R-ohjelmointi.org

Tilastotieteellistä ohjelmointia R-kielellä

lokakuu, 2012

Kurssimateriaalia suomeksi

R:n opiskelusta kiinnostuneille löytyy englanniksi paljon materiaalia verkosta. Suomeksi alkeisoppaita on kovin vähän tarjolla. Yksi lisäys tähän tarjoomaan on Tuomas Rajalan Jyväskylän yliopiston tilastotieteen laitoksella valmistelema R-kurssimateriaali. Tuomaksen mukaan materiaalin on tarkoitus toimia ”matalan kynnyksen” oppaana R-maailmaan. Ehdottomasti tutustumisen arvoinen kokonaisuus myös edistyneemmälle R-kehittäjälle.

Posted in R-ohjelmointi, Yleistä | Kommentit pois päältä artikkelissa Kurssimateriaalia suomeksi

Uusien annotaatiopakettien luominen AnnotationDbi:n työkaluilla

DNA-siruaineistojen analysoimiseen R:ssä voidaan käyttää Bioconductor-projektin tuottamia lajennuspaketteja. Monet normalisointia monimutkaisemmat analyysivaiheet vaativat tueksi annotaatiopaketin, joka yhdistää sirulla olevat koettimet muun muassa niiden kohdegeenien toiminnalliseen kuvaukseen. Bioconductor-projekti tuottaa annotaatiopaketteja yleisimmille siruille, ja ne löytyvät projektin sivuilta metadata- tai AnnotationData-nimellä. Kaikille markkinoilla oleville siruille annotaatiopaketteja ei projektin sivuilta kuitenkaan löydy, ja niinpä uusia annotaatiopaketteja voi olla […]

Posted in BioConductor | 2 Comments »

Ajatusten lukua R:llä

R-listoilla nähtyjä ”repäisyjä” keräävä fortunes-laajennuspaketti sisältää mm. seuraavan: library(fortunes) fortune(182)library(fortunes) fortune(182) Brian Ripley: Where did you tell it […]? (Nowhere: R is lacking a mind_read() function!) Peter Dalgaard: Please stop complaining about missing features. Patches will be considered. Oh, it’s you, Brian. Never mind then. You’ll get to it, I’m sure. 😉 — Brian Ripley […]

Posted in Muu ohjelmointi | Kommentit pois päältä artikkelissa Ajatusten lukua R:llä