R-ohjelmointi.org

Tilastotieteellistä ohjelmointia R-kielellä

maaliskuu, 2011

Laboratoriomenetelmien vertaaminen

Bland-Altmanin kuvio on eräs perinteinen tapa verrata kahden laboratoriotutkimuksen antamia tuloksia toisiinsa. Bendix Carstensenin ohjelmoima R-laajennuspaketti MethComp sisältää paljon muitakin menetelmiä, jotka soveltuvat esimerkiksi tilanteisiin, joissa harha ei olekaan vakio koko mittausalueella. Pakettiin liittyy myös vasta ilmestynyt kirja Comparing Clinical Measurement Methods: A Practical Guide.

Posted in Yleistä | No Comments »

Analyysisovellusten suosio

Oheisessa artikkelissa käydään läpi eri analyysisovellusten suosion kehitystä viimeisten kahden vuosikymmenen osalta. Mielenkiintoista luettavaa, R näyttää olevan nousussa, ainakin näillä mittareilla mitattuna.

Posted in R-ohjelmointi, Yleistä | No Comments »

More-funktio

i’m a chordata! urochordata!-blogi julkaisi kätevän more-funktion, jolla saa ison tulostuksen näppärästi omaan ikuunaansa. Onhan näitä muitakin vaihtoehtoja, mutta otin kyllä funktion talteen skriptiarkistooni.

Posted in R-ohjelmointi, Skriptit | No Comments »

win-builder: R-pakettien kääntäminen Windows:iin

R-projektin sivuilta löytyy apukeino (win-builder) tarpeeseen, jossa R-paketti on tarpeen kääntää toimimaan Windows:ssa. Paketteja voi toki kääntää myös, jos ensin asentaa Windows-ympäristöön tarvittavat työkalut (R-tools), mutta win-builderiä käyttäen välttyy tältä vaivalta. Win-builder -palvelun käyttämiseksi käännettävän paketin DESCRIPTION-tiedostossa on ilmoitettava ylläpitäjä-kentässä (maintainer) oma nimi ja toimiva sähköpostiosoite, sillä ilmoitus paketin kääntämisestä lähetetään ilmoitettuun osoitteeseen.

Posted in Aiheeton | No Comments »

R:n kehitysversiot

R 2.13.0 julkaistaan 13.4.2011. Piakkoin sen jälkeen yleensä julkaistaan myös uusi Bioconductor:n versio. R:n kehitysversioon tehdyistä muutoksista löytyy tieto kehitysversion R News-sivulta. Pakettien toimivuudesta tulevassa versiossa saa tietoa CRAN:n ja Bioconductor:n Build Report-sivuilta.

Posted in Aiheeton | No Comments »

Category